В 2026 году около 50 резидентов инновационного центра Сколково столкнулись с претензиями со стороны налоговых органов. Рост числа споров обусловлен отменой моратория на проведение выездных проверок IT-компаний в России, который перестал действовать с марта 2025 года. Юристы отмечают, что даже добросовестные организации подвергаются риску из-за сложившегося пробюджетного подхода при разрешении подобных конфликтов.

Одной из главных причин доначислений становится утрата преференций* при превышении прибыли в 300 млн ₽. В таких случаях налог и пени рассчитываются ретроспективно с начала года. Многие компании пытались перейти на льготы по государственной IT-аккредитации, однако ведомства часто требуют доплатить налог за текущий период, разрешая применять новые послабления только со следующего года. Кроме того, организации лишаются преференций при временном исключении из реестра из-за несвоевременной подачи документов, при этом пониженные тарифы страховых взносов возвращаются только с месяца восстановления статуса.

Особое внимание проверяющие уделяют дроблению бизнеса**, когда процессы искусственно переводятся на специализированную IT-компанию для снижения налоговой нагрузки. Риски возникают при неразделимости функций, общих сотрудниках и завышении стоимости услуг. Эксперты подчеркивают, что при защите от формальных претензий необходимо доказывать наличие самостоятельных деловых целей и подтверждать реальность деятельности внутренними документами. Судебная практика показывает, что компаниям иногда удается успешно оспаривать решения ведомств, однако безусловный результат не гарантирован.

*Преференция — это особые налоговые льготы или преимущества, предоставляемые государством определенным категориям налогоплательщиков для поддержки их деятельности. В контексте Сколково они включают освобождение от налога на прибыль, НДС и налога на имущество, а также применение пониженных тарифов страховых взносов.

**Дробление бизнеса — это искусственное разделение единой предпринимательской деятельности между несколькими взаимозависимыми лицами для создания видимости соответствия критериям льготных режимов. Налоговые органы рассматривают такие действия как схему уклонения от налогов, если у разделения нет реальной деловой цели, кроме получения налоговой выгоды.

Подпишись на MP в MAX